1.如果被告方提出诉讼时效抗辩且原告无法证明存在诉讼时效中断的情形时，双方可以尝试通过协商达成新的工程款支付协议。

2.协商过程中应充分考虑双方的实际情况和利益诉求，力求达成公平合理的协议。如果协商成功，双方可以签订书面协议并按照约定履行支付义务。这样可以避免进一步的法律纠纷和诉讼成本。

总之，在处理工程欠款超过5年的问题时，债权人应充分了解诉讼时效的规定并采取相应的措施来保护自己的权益。同时，双方也应积极沟通协商寻求解决方案以避免进一步的法律纠纷。